Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lamp5Q9D387 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lamp5Q9D387 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lamp5Q9D387 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lamp5Q9D387 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lamp5Q9D387 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lamp5Q9D387 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lamp5Q9D387 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lamp5Q9D387 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Lamp5Q9D387 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lamp5Q9D387 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Lamp5Q9D387 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms