Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R6

Coa3, Cytochrome c oxidase assembly factor 3 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coa3Q9D2R6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Coa3Q9D2R6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coa3Q9D2R6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms