Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D2Q3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms