Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt44Q9D2Q2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt44Q9D2Q2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms