Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2G5

Synj2, Synaptojanin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synj2Q9D2G5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Synj2Q9D2G5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Synj2Q9D2G5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Synj2Q9D2G5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms