Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramef12Q9D2F1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramef12Q9D2F1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms