Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cysrt1Q9D1E4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms