Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syf2Q9D198 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms