Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hddc3Q9D114 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hddc3Q9D114 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms