Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem53Q9D0Z3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms