Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc47Q9D024 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc47Q9D024 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms