Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Shisa9Q9CZN4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa9Q9CZN4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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