Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mis18aQ9CZJ6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mis18aQ9CZJ6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mis18aQ9CZJ6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mis18aQ9CZJ6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mis18aQ9CZJ6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mis18aQ9CZJ6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mis18aQ9CZJ6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mis18aQ9CZJ6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mis18aQ9CZJ6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mis18aQ9CZJ6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mis18aQ9CZJ6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mis18aQ9CZJ6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mis18aQ9CZJ6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mis18aQ9CZJ6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mis18aQ9CZJ6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mis18aQ9CZJ6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis18aQ9CZJ6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis18aQ9CZJ6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis18aQ9CZJ6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis18aQ9CZJ6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Mis18aQ9CZJ6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms