Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ6

Rex1bd, Required for excision 1-B domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rex1bdQ9CYZ6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rex1bdQ9CYZ6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rex1bdQ9CYZ6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms