Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrps28Q9CY16 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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