Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
3100002H09RikQ9CXW6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms