Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Sgo1Q9CXH7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Sgo1Q9CXH7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Sgo1Q9CXH7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgo1Q9CXH7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Sgo1Q9CXH7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Sgo1Q9CXH7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Sgo1Q9CXH7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Sgo1Q9CXH7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Sgo1Q9CXH7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Sgo1Q9CXH7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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