Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed5Q9CXE7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmed5Q9CXE7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms