Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RpainQ9CWY9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RpainQ9CWY9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RpainQ9CWY9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RpainQ9CWY9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RpainQ9CWY9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RpainQ9CWY9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RpainQ9CWY9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RpainQ9CWY9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RpainQ9CWY9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RpainQ9CWY9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RpainQ9CWY9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RpainQ9CWY9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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