Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CWU4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CWU4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CWU4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CWU4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CWU4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CWU4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CWU4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CWU4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9CWU4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CWU4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CWU4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9CWU4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms