Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn1Q9CWM4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms