Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sft2d3Q9CSV6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d3Q9CSV6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms