Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp5sQ9CRA7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms