Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms