Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2Q9CQP2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2Q9CQP2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.3 ms