Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pkp2Q9CQ73 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pkp2Q9CQ73 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms