Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ70

H2afb1, Histone H2A-Bbd type 1, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb1Q9CQ70 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2afb1Q9CQ70 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afb1Q9CQ70 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afb1Q9CQ70 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afb1Q9CQ70 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afb1Q9CQ70 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afb1Q9CQ70 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afb1Q9CQ70 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afb1Q9CQ70 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms