Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc198Q9CPZ1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms