Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ska1Q9CPV1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska1Q9CPV1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms