Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpl17Q9CPR4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpl17Q9CPR4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpl17Q9CPR4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpl17Q9CPR4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpl17Q9CPR4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpl17Q9CPR4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpl17Q9CPR4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpl17Q9CPR4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rpl17Q9CPR4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Rpl17Q9CPR4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rpl17Q9CPR4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rpl17Q9CPR4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms