Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ15

NABP2, SOSS complex subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP2Q9BQ15 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NABP2Q9BQ15 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NABP2Q9BQ15 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms