Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN0

Slc5a5, Sodium/iodide cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a5Q99PN0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc5a5Q99PN0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc5a5Q99PN0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms