Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GpnmbQ99P91 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GpnmbQ99P91 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms