Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep41Q99NF3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep41Q99NF3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms