Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NsmfQ99NF2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms