Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rims1Q99NE5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rims1Q99NE5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms