Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms