Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tdrd1Q99MV1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms