Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdpd3Q99LY2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms