Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99LU8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99LU8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99LU8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99LU8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99LU8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99LU8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99LU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99LU8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99LU8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99LU8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99LU8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99LU8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99LU8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99LU8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99LU8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99LU8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99LU8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99LU8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99LU8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99LU8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99LU8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99LU8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99LU8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99LU8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99LU8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99LU8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99LU8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99LU8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99LU8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99LU8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99LU8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99LU8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99LU8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q99LU8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q99LU8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q99LU8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99LU8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99LU8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99LU8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99LU8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99LU8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99LU8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99LU8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99LU8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99LU8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99LU8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99LU8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99LU8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q99LU8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q99LU8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q99LU8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q99LU8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q99LU8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q99LU8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q99LU8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q99LU8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q99LU8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q99LU8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q99LU8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q99LU8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q99LU8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q99LU8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q99LU8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q99LU8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q99LU8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q99LU8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q99LU8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q99LU8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q99LU8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q99LU8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q99LU8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms