Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rcbtb2Q99LJ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rcbtb2Q99LJ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms