Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnpo2Q99LG2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms