Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nmd3Q99L48 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms