Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmp1Q99KU0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmp1Q99KU0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms