Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PpifQ99KR7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PpifQ99KR7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms