Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Reep3Q99KK1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Reep3Q99KK1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms