Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps4Q99KG7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms