Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Me2Q99KE1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Me2Q99KE1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Me2Q99KE1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms