Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf11Q99JX1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf11Q99JX1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms