Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tlcd1Q99JT6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlcd1Q99JT6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms